Od 1951 Władysław Miziołek był prefektem alumnów w seminarium archidiecezjalnym. od 1957 kanonikiem gremialny Kapituły Warszawskiej, w której doszedł aż do godności scholastyka. W latach 1957 - 1969 był rektorem Metropolitalnego Seminarium Duchownego w Warszawie. w charakterze prefekt, zaś odtąd rektor, Miziołek walczył z władzami państwowymi o różne majątki kościelne, które władze chciały upaństwowić.